Каталог MCP
longevity-genie/opengenes-mcp

longevity-genie/opengenes-mcp

MCP-сервер для базы данных OpenGenes по старению и долголетию. Выполняйте SQL-запросы к данным о lifespan, ассоциациях и критериях. Автоматическая загрузка свежих данных. Идеален для AI-агентов в г...

README

3 инструмента

Версии

Установить сервер

opengenes-mcp

MCP (Model Context Protocol) server for OpenGenes database

This server implements the Model Context Protocol (MCP) for OpenGenes, providing a standardized interface for accessing aging and longevity research data. MCP enables AI assistants and agents to query comprehensive biomedical datasets through structured interfaces.

The server automatically downloads the latest OpenGenes database and documentation from Hugging Face Hub (specifically from the opengenes folder), ensuring you always have access to the most up-to-date data without manual file management.

The OpenGenes database contains:

lifespan_change: Experimental data about genetic interventions and their effects on lifespan across model organisms
gene_criteria: Criteria classifications for aging-related genes (12 different categories)
gene_hallmarks: Hallmarks of aging associated with specific genes
longevity_associations: Genetic variants associated with longevity from population studies

If you want to understand more about what the Model Context Protocol is and how to use it more efficiently, you can take the DeepLearning AI Course or search for MCP videos on YouTube.

Инструменты были проиндексированы: 09.09.2026

opengenes_db_query

Запрашивает базу данных Opengenes, которая содержит данные о генах, участвующих в долголетии, экспериментах по продлению жизни на модельных организмах и изменениях у человека и других организмов с возрастом. Перед первым вызовом этого инструмента всегда проверяйте инструменты, которые предоставляют информацию о схеме и примеры запросов.

Запросить данные из базы Opengenes.

Параметры

sqlstringобязательный
The SQL query to execute (database enforces read-only access)

opengenes_example_queries

Получает список примеров SQL-запросов.

Opengenes Примеры запросов

Параметры

Без параметров.

opengenes_get_schema_info

Получить информацию о схеме базы данных

Opengenes Get Schema Info

Параметры

Без параметров.

Github Сайт сервера

Конфиг для установки сервера

{
  "command": "uvx",
  "args": [
    "opengenes-mcp"
  ],
  "env": {
    "MCP_TRANSPORT": "stdio"
  }
}

Нужен uvx

Сервер запускается через uvx
Без него ничего работать не будет.

Как установить uvx

FAQ

Для чего этот сервер?

Этот сервер даёт AI-ассистентам прямой доступ к базе OpenGenes с данными о генетических вмешательствах и их влиянии на продолжительность жизни. Вместо того чтобы искать информацию по статьям вручную, учёный или разработчик просто задаёт вопрос на естественном языке — и AI выполняет нужные SQL-запросы, получая актуальные результаты по старению и долголетию.

Что он умеет?

Сервер opengenes-mcp реализует протокол MCP для базы OpenGenes, которая хранит данные о влиянии генов на продолжительность жизни, критерии геронтологических генов, ассоциации с долголетием и признаки старения. Он автоматически скачивает свежую базу с Hugging Face Hub, кэширует файлы локально и работает без интернета через локальные резервные копии. Сервер выставляет три инструмента: получает схему базы, возвращает примеры SQL-запросов и выполняет произвольные SQL-запросы к данным. Входит в экосистему Holy Bio MCP вместе с серверами для геномики, синергии генов, биофармакологии и общих био-данных.

Информация о сервере

Номер в рейтинге: #196
Звезд на Github: 21
Форков на Github: 5
Загрузок: 906
Язык реализации: Python
Лицензия: MIT
Официальный сервер: Нет
Дата обновления данных: 09.09 в 03:46
Идентификатор: 6EbnUFeB51MJHjGT
Категории: Агенты, Базы данных, Биология и медицина, Здоровье и Wellness, Знания и память, ИИ и машинное обучение, Исследования и данные

Похожие MCP-сервера

longevity-genie/gget-mcp

MCP сервер для библиотеки gget: AI-ассистенты выполняют сложные запросы к геномным базам: поиск генов, BLAST и предсказание белков. Инструмент полезен биоинформатикам для анализа геномики через естественный язык.

ammawla/encode-toolkit

MCP-сервер для геномных исследований: поиск по ENCODE, интеграция 14 баз (GTEx, ClinVar, GWAS) и запуск пайплайнов с генерацией методов - всё на естественном языке в Claude. Для биоинформатиков и г...

wso2/fhir-mcp-server

официальный

MCP сервер для FHIR API. Интегрирует AI-инструменты с медицинскими данными: поиск, чтение и запись ресурсов. Поддерживает SMART-on-FHIR аутентификацию и FHIRPath-фильтрацию. Для разработчиков и инт...

thelongevityvault/decoder-3am-mcp

Сервер классифицирует биологические причины ночных пробуждений по пятифакторной системе биологических механизмов. Помогает пользователям точно определить источник нарушений сна вместо общих советов.

SidneyBissoli/medical-terminologies-mcp

MCP сервер для унифицированного доступа к глобальным медицинским терминологиям: ICD-11, LOINC, RxNorm, MeSH, ATC и другим. Более 30 инструментов для поиска кодов, сопоставления терминов и валидации...

jparkerweb/mcp-sqlite

MCP сервер для работы с SQLite: выполняет CRUD-операции, исследование схемы таблиц и произвольные SQL-запросы. Полезен разработчикам, управляющим базами данных через ИИ-ассистентов.