Для чего этот сервер?

Этот сервер даёт AI-ассистентам прямой доступ к базе OpenGenes с данными о генетических вмешательствах и их влиянии на продолжительность жизни. Вместо того чтобы искать информацию по статьям вручную, учёный или разработчик просто задаёт вопрос на естественном языке — и AI выполняет нужные SQL-запросы, получая актуальные результаты по старению и долголетию.

Что он умеет?

Сервер даёт доступ к базе OpenGenes по старению и долголетию: выполняет SQL-запросы через opengenes_db_query, вытаскивает данные об экспериментах с генами и их влиянии на продолжительность жизни модельных организмов, показывает классификации геронтогенов по 12 критериям, hallmarks старения и варианты генов, связанные с долголетием. Ещё отдаёт схему базы и примеры запросов, а данные сам подтягивает с Hugging Face.

Каталог MCP
longevity-genie/opengenes-mcp

longevity-genie/opengenes-mcp

от longevity-genie

Ищет данные о старении и долголетии в базе OpenGenes: выполняет SQL-запросы, показывает схему БД и примеры запросов. Данные сами обновляются с Hugging Face.

Github PyPi Сайт сервера

README

3 инструмента

Версии

Установить сервер

opengenes-mcp

MCP (Model Context Protocol) server for OpenGenes database

This server implements the Model Context Protocol (MCP) for OpenGenes, providing a standardized interface for accessing aging and longevity research data. MCP enables AI assistants and agents to query comprehensive biomedical datasets through structured interfaces.

The server automatically downloads the latest OpenGenes database and documentation from Hugging Face Hub (specifically from the opengenes folder), ensuring you always have access to the most up-to-date data without manual file management.

The OpenGenes database contains:

lifespan_change: Experimental data about genetic interventions and their effects on lifespan across model organisms
gene_criteria: Criteria classifications for aging-related genes (12 different categories)
gene_hallmarks: Hallmarks of aging associated with specific genes
longevity_associations: Genetic variants associated with longevity from population studies

If you want to understand more about what the Model Context Protocol is and how to use it more efficiently, you can take the DeepLearning AI Course or search for MCP videos on YouTube.

Часто задаваемые вопросы

Инструменты были проиндексированы: 15.10.2026

opengenes_db_query

Запрашивает базу данных Opengenes, которая содержит данные о генах, участвующих в долголетии, экспериментах по продлению жизни на модельных организмах и изменениях у человека и других организмов с возрастом. Перед первым вызовом этого инструмента всегда проверяйте инструменты, которые предоставляют информацию о схеме и примеры запросов.

Параметры

sqlstringобязательный
SQL-запрос для выполнения (база данных разрешает только чтение)

opengenes_example_queries

Получает список примеров SQL-запросов.

Параметры

Без параметров.

opengenes_get_schema_info

Получить информацию о схеме базы данных

Параметры

Без параметров.

`0.2.0`основная	15.10.2025
`0.1.4`	01.07.2025
`0.1.3`	27.06.2025
`0.1.2`	06.06.2025
`0.1.0`	06.06.2025

Выберите клиент, чтобы установить longevity-genie/opengenes-mcp:

Любой клиент

Конфиг добавления MCP сервера стандартный, обычно он не меняется вообще, поэтому подходит практически к любому ИИ клиенту, поддерживающему MCP.

{
  "mcpServers": {
    "longevity-genie-opengenes-mcp-fk0v21adcu": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "opengenes-mcp"
      ],
      "env": {
        "MCP_TRANSPORT": "stdio"
      }
    }
  }
}

Cursor

Перейдите по ссылке и сервер автоматически будет добавлен в Cursor. Либо откройте/создайте файл ~/.cursor/mcp.json(%USERPROFILE%\.cursor\mcp.json на Windows) и добавьте конфиг сервера:

{
  "mcpServers": {
    "longevity-genie-opengenes-mcp-fk0v21adcu": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "opengenes-mcp"
      ],
      "env": {
        "MCP_TRANSPORT": "stdio"
      }
    }
  }
}

VS Code

Создайте .vscode/mcp.json в проекте (ключ верхнего уровня — servers):

{
  "servers": {
    "longevity-genie-opengenes-mcp-fk0v21adcu": {
      "type": "stdio",
      "command": "uvx",
      "args": [
        "opengenes-mcp"
      ],
      "env": {
        "MCP_TRANSPORT": "stdio"
      }
    }
  }
}

Либо добавьте сервер через терминал:

code --add-mcp "{\"name\":\"longevity-genie-opengenes-mcp-fk0v21adcu\",\"type\":\"stdio\",\"command\":\"uvx\",\"args\":[\"opengenes-mcp\"],\"env\":{\"MCP_TRANSPORT\":\"stdio\"}}"

Claude Desktop

Откройте Settings → Developer → Edit Config — это откроет файл claude_desktop_config.json:

macOS: ~/Library/Application Support/Claude/claude_desktop_config.json
Windows: %APPDATA%\Claude\claude_desktop_config.json

Впишите сервер и полностью перезапустите Claude Desktop:

{
  "mcpServers": {
    "longevity-genie-opengenes-mcp-fk0v21adcu": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "opengenes-mcp"
      ],
      "env": {
        "MCP_TRANSPORT": "stdio"
      }
    }
  }
}

Claude Code

Добавьте сервер одной командой в терминале:

claude mcp add longevity-genie-opengenes-mcp-fk0v21adcu --env MCP_TRANSPORT=stdio -- uvx opengenes-mcp

Либо через JSON-конфиг:

claude mcp add-json longevity-genie-opengenes-mcp-fk0v21adcu "{\"command\":\"uvx\",\"args\":[\"opengenes-mcp\"],\"env\":{\"MCP_TRANSPORT\":\"stdio\"}}"

Codex

Добавьте сервер командой в терминале:

codex mcp add longevity-genie-opengenes-mcp-fk0v21adcu --env MCP_TRANSPORT=stdio -- uvx opengenes-mcp

Либо вручную в ~/.codex/config.toml(%USERPROFILE%\.codex\config.toml на Windows):

[mcp_servers.longevity-genie-opengenes-mcp-fk0v21adcu]
command = "uvx"
args = ["opengenes-mcp"]

[mcp_servers.longevity-genie-opengenes-mcp-fk0v21adcu.env]
MCP_TRANSPORT = "stdio"

Perplexity

MCP доступен подписчикам Perplexity Pro / Max / Enterprise. Локальные серверы — только в приложении для macOS.

Откройте Настройки аккаунта → Connectors.
Установите вспомогательное приложение PerplexityXPC (один раз).
Нажмите Add Connector → вкладка Simple.
В поле Server Name укажите longevity-genie/opengenes-mcp, а в поле команды запуска — строку ниже:

uvx opengenes-mcp

Нажмите Save и дождитесь статуса Running.

Windsurf

Откройте Windsurf Settings → Cascade → MCP Servers или отредактируйте файл ~/.codeium/windsurf/mcp_config.json:

{
  "mcpServers": {
    "longevity-genie-opengenes-mcp-fk0v21adcu": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "opengenes-mcp"
      ],
      "env": {
        "MCP_TRANSPORT": "stdio"
      }
    }
  }
}

Cline

В панели Cline нажмите иконку MCP Servers → Configure → Configure MCP Servers (или отредактируйте ~/.cline/mcp.json) и добавьте сервер:

{
  "mcpServers": {
    "longevity-genie-opengenes-mcp-fk0v21adcu": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "opengenes-mcp"
      ],
      "env": {
        "MCP_TRANSPORT": "stdio"
      },
      "disabled": false,
      "autoApprove": []
    }
  }
}

Continue

Создайте файл в .continue/mcpServers/ (например longevity-genie-opengenes-mcp-fk0v21adcu.yaml) или добавьте блок в config.yaml. MCP работает только в режиме agent:

mcpServers:
  - name: longevity-genie-opengenes-mcp-fk0v21adcu
    command: uvx
    args:
      - "opengenes-mcp"
    env:
      MCP_TRANSPORT: stdio

Zed

Выполните agent: add context server или откройте настройки (zed: open settings file) и добавьте сервер в объект context_servers:

{
  "context_servers": {
    "longevity-genie-opengenes-mcp-fk0v21adcu": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "opengenes-mcp"
      ],
      "env": {
        "MCP_TRANSPORT": "stdio"
      }
    }
  }
}

Конфиг для установки сервера

{
  "command": "uvx",
  "args": [
    "opengenes-mcp"
  ],
  "env": {
    "MCP_TRANSPORT": "stdio"
  }
}

Нужен uvx

Сервер запускается через uvx
Без него ничего работать не будет.

Как установить uvx

Информация о сервере

Номер в рейтинге: #195
Звезд на Github: 21
Форков на Github: 5
Загрузок: 889
Язык реализации: Python
Лицензия: MIT
Официальный сервер: Нет
Дата обновления данных: 19.10 в 10:34
Идентификатор: 6EbnUFeB51MJHjGT
Категории: Здоровье и медицина, Исследования и данные

longevity-genie/opengenes-mcp

opengenes-mcp

Часто задаваемые вопросы

Похожие MCP-сервера

longevity-genie/gget-mcp

ammawla/encode-toolkit

cafferychen777/ChatSpatial

neptun2000/heor-agent-mcp

SidneyBissoli/medical-terminologies-mcp

musharna/plant-genomics-mcp